MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 plasmid C

Total Repeats: 820

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007412	ATAG	2	8	188942	188949	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
502	NC_007412	AAAT	2	8	188992	188999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_007412	A	6	6	189016	189021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_007412	TGA	2	6	189076	189081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_007412	TGA	2	6	189181	189186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_007412	ATTA	2	8	189268	189275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_007412	ATGT	2	8	189403	189410	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
508	NC_007412	A	6	6	189414	189419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_007412	GAG	2	6	189440	189445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_007412	AT	3	6	189494	189499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_007412	TGA	2	6	189789	189794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_007412	ATTT	2	8	189799	189806	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_007412	ACA	2	6	189820	189825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_007412	TGA	3	9	189847	189855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_007412	TCTT	2	8	191318	191325	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
516	NC_007412	A	9	9	191457	191465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_007412	AGT	2	6	191518	191523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_007412	TA	3	6	191543	191548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_007412	ATA	2	6	191674	191679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_007412	AATTA	2	10	191688	191697	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_007412	T	6	6	191724	191729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_007412	AAT	2	6	191818	191823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_007412	GT	3	6	191845	191850	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
524	NC_007412	T	6	6	191852	191857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_007412	CAA	2	6	191868	191873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_007412	A	6	6	191879	191884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_007412	TC	3	6	192350	192355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
528	NC_007412	ATTG	2	8	192359	192366	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
529	NC_007412	CAT	2	6	192408	192413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_007412	AATC	2	8	192420	192427	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
531	NC_007412	ACT	2	6	192458	192463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_007412	TAA	2	6	192493	192498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_007412	AAAT	2	8	192611	192618	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_007412	TCC	2	6	192701	192706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_007412	CGCTAC	2	12	192748	192759	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
536	NC_007412	T	7	7	192806	192812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_007412	AAGC	2	8	195065	195072	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
538	NC_007412	TC	3	6	195106	195111	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
539	NC_007412	CAG	2	6	195718	195723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_007412	A	6	6	195773	195778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_007412	ATT	2	6	195791	195796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_007412	CCT	2	6	195829	195834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_007412	A	6	6	195849	195854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_007412	TGA	2	6	195906	195911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_007412	GAG	2	6	195914	195919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_007412	GTAAAA	2	12	195941	195952	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_007412	TAC	2	6	196162	196167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_007412	TTTC	2	8	196191	196198	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
549	NC_007412	TC	5	10	196197	196206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
550	NC_007412	TAGT	2	8	197423	197430	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
551	NC_007412	CTC	2	6	197468	197473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_007412	CAA	2	6	197841	197846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_007412	TGCT	2	8	198392	198399	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
554	NC_007412	A	9	9	198472	198480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_007412	AGT	2	6	198533	198538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_007412	CATT	2	8	198624	198631	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
557	NC_007412	AAAT	2	8	198897	198904	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_007412	A	6	6	198941	198946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_007412	TAA	2	6	198998	199003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_007412	T	6	6	199068	199073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_007412	GTT	2	6	199115	199120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_007412	TAA	2	6	199164	199169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_007412	GGT	2	6	199242	199247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_007412	TTA	2	6	199249	199254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_007412	GAAAA	2	10	199402	199411	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
566	NC_007412	TTAT	2	8	199436	199443	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_007412	T	6	6	201051	201056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_007412	CT	3	6	201067	201072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
569	NC_007412	AGA	2	6	201077	201082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_007412	CTA	2	6	201085	201090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_007412	AGTC	2	8	201193	201200	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
572	NC_007412	A	7	7	201215	201221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_007412	CGC	2	6	203593	203598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_007412	GCG	2	6	203659	203664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_007412	AAGC	2	8	203715	203722	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
576	NC_007412	GCT	3	9	203763	203771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_007412	TAG	2	6	203822	203827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_007412	T	6	6	203843	203848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_007412	AGA	2	6	203871	203876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_007412	AAG	2	6	203907	203912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_007412	AAT	2	6	204286	204291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_007412	ATTT	2	8	204329	204336	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_007412	T	6	6	204334	204339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_007412	TCA	2	6	204372	204377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_007412	A	6	6	204381	204386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_007412	GCA	2	6	204868	204873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_007412	T	7	7	204892	204898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_007412	ATTT	2	8	204904	204911	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_007412	CAG	2	6	206255	206260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_007412	A	6	6	206277	206282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_007412	ATC	2	6	206293	206298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_007412	T	9	9	206301	206309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_007412	CAC	2	6	206329	206334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_007412	C	6	6	206984	206989	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
595	NC_007412	AGTT	2	8	206994	207001	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
596	NC_007412	ACA	2	6	207002	207007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_007412	TAA	2	6	207016	207021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_007412	TAAT	2	8	207042	207049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_007412	TAC	2	6	207074	207079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_007412	GTA	2	6	207085	207090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_007412	A	6	6	207237	207242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_007412	TATT	2	8	207247	207254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_007412	ATT	2	6	207261	207266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_007412	AC	3	6	207308	207313	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
605	NC_007412	CT	3	6	207339	207344	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
606	NC_007412	CTA	2	6	207374	207379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_007412	GTA	2	6	207410	207415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_007412	TAT	2	6	207454	207459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_007412	AAT	2	6	207461	207466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_007412	AATT	2	8	207470	207477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_007412	ATA	2	6	207479	207484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_007412	GTA	2	6	207531	207536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_007412	ATCTA	2	10	207540	207549	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
614	NC_007412	ATTAA	2	10	207599	207608	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_007412	TA	3	6	207612	207617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_007412	ATT	2	6	207648	207653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_007412	T	6	6	207665	207670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_007412	AATA	2	8	207715	207722	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_007412	TAT	2	6	207730	207735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_007412	A	6	6	207743	207748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_007412	AAGT	2	8	207805	207812	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
622	NC_007412	AAT	2	6	207827	207832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_007412	TTG	2	6	208452	208457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_007412	AT	4	8	208517	208524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_007412	AAG	2	6	208541	208546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_007412	AAT	2	6	208591	208596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_007412	CTA	2	6	208674	208679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_007412	A	6	6	208713	208718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_007412	A	6	6	210389	210394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_007412	T	6	6	210433	210438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_007412	TATT	2	8	210446	210453	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_007412	TTAG	2	8	211089	211096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
633	NC_007412	ACA	2	6	211224	211229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_007412	CGT	2	6	211276	211281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_007412	GGGAA	2	10	211436	211445	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
636	NC_007412	TTC	2	6	211458	211463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_007412	TA	3	6	211492	211497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_007412	TTA	2	6	211524	211529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_007412	TCT	2	6	211669	211674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_007412	AAC	2	6	211677	211682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_007412	TA	3	6	211763	211768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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657	NC_007412	TTG	2	6	213703	213708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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663	NC_007412	AAG	2	6	223714	223719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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781	NC_007412	TTG	2	6	274277	274282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
782	NC_007412	T	6	6	274284	274289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
783	NC_007412	ACT	2	6	285094	285099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
784	NC_007412	T	6	6	285139	285144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
785	NC_007412	AGC	2	6	285146	285151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
786	NC_007412	TAG	2	6	285154	285159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
787	NC_007412	AAT	2	6	285193	285198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
788	NC_007412	GCAA	2	8	285264	285271	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
789	NC_007412	TA	3	6	285317	285322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
790	NC_007412	TAT	3	9	285338	285346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
791	NC_007412	AACT	2	8	285382	285389	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
792	NC_007412	T	6	6	285412	285417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
793	NC_007412	T	8	8	285499	285506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
794	NC_007412	TTGA	2	8	292286	292293	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
795	NC_007412	CAT	2	6	292312	292317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
796	NC_007412	GCT	2	6	292445	292450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
797	NC_007412	A	6	6	292596	292601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
798	NC_007412	TGT	2	6	293201	293206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
799	NC_007412	TACT	2	8	293260	293267	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
800	NC_007412	CAT	2	6	293315	293320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
801	NC_007412	ATT	2	6	293354	293359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
802	NC_007412	CAT	2	6	293428	293433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
803	NC_007412	GCGTAG	3	18	294550	294567	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
804	NC_007412	TC	3	6	294568	294573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
805	NC_007412	TCA	2	6	294625	294630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
806	NC_007412	AAG	2	6	294746	294751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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809	NC_007412	TAG	2	6	295888	295893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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811	NC_007412	ATT	2	6	298704	298709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
812	NC_007412	ATT	2	6	298749	298754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
813	NC_007412	GAG	2	6	298763	298768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
814	NC_007412	ATT	2	6	298794	298799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
815	NC_007412	TACT	2	8	298842	298849	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
816	NC_007412	AAT	2	6	298904	298909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
817	NC_007412	A	6	6	298940	298945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
818	NC_007412	TCC	2	6	299329	299334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
819	NC_007412	ACAA	2	8	299383	299390	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
820	NC_007412	ATT	2	6	299434	299439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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